TUAWによると、Apple DiscussionにMacBook (Late 2008)のユーザーからサードパーティー製のメモリに載せ替えたところシステムが不安定になるといった報告が多数寄せられているそうです。
CrucialやOWCといったMacとの互換性を謳っている業者で換装したユーザーからも問題が報告されているようで、解決策としては、Appleによって商標が付けられたメモリを使用することだそうです。
なお、この原因については詳しく分かっていないようです。
ウェブで検索していると全てがそうとは限らないようなので相性問題ということもあるのかもしれませんが、新MacBookでメモリを自分で換装する際は他のモデルよりも気を遣わなければならないことは間違い無い模様。